Uma farmácia de manipulação é um comércio de prestação de serviço. Onde são aviadas receitas, manipuladas, dispensadas fórmulas mediante prescrição de algum profissional de saúde habilitado.

Quando a farmácia trabalha segundo as normas da RDC 67, que regulariza as farmácias de manipulação com relação à qualidade, normas e procedimentos a serem seguidos, trabalham com fornecedores qualificados e habilitados nas normas e na legislação.

Farmácia de manipulação existe para que possam ser manipuladas diversas fórmulas, para, principalmente, ajudar as pessoas num tratamento individualizado.

Desde dosagem até a quantidade exata do tratamento evitando assim desperdício. Na farmácia de manipulação, trabalha-se com diferentes formas farmacêuticas, a que mais facilitará a adesão ao tratamento pelo paciente como, por exemplo,  medicamentos para crianças em baixas doses, que a indústria tradicional não atua.

A farmácia de manipulação pode vender todo tipo de medicamento. Já a farmácia comercial (como é conhecida) não podem manipular pois não possuem laboratórios e não podem fazer captação de receita (salvo se tiver alguma liminar para isso).